(1) วัสดุก่อสร้างส่วนใหญ่ที่ใช้ในโรงแรมแคปซูลคือ FRP ซึ่งเป็นวัสดุที่ติดไฟได้ นอกจากนี้พื้นที่โรงแรมยังค่อนข้างปิดและมีบุคลากรหนาแน่น เมื่อเกิดเพลิงไหม้ การอพยพบุคลากรย่อมเป็นปัญหาอย่างแน่นอน
(2) พื้นที่มีขนาดเล็ก และอพาร์ทเมนท์แคปซูลมีขนาดเล็กเป็นหลัก โดยทั่วไปพื้นที่จะสามารถรองรับได้เพียงคนเดียว คุณสามารถนอน นั่ง ดูทีวี และท่องอินเทอร์เน็ตได้ ชุดอวัยวะภายในอพาร์ทเมนต์สำหรับเยาวชนที่มีขนาดไม่ถึงสองตารางเมตร
(3) ผลของฉนวนกันเสียงไม่ดี โดยทั่วไปอพาร์ทเมนท์แคปซูลจะเป็นพื้นที่สาธารณะ ดังนั้นในสภาพแวดล้อมเช่นนี้คุณภาพของบุคลากรจึงค่อนข้างสูง เนื่องจากพื้นที่ขนาดเล็ก ระยะทางจึงน้อย ฉนวนกันเสียงจึงค่อนข้างแย่